学校组建了以服务库区卫生事业和医药产业发展为宗旨的重庆市三峡医药卫生职业教育理事会，积极探索在政府主导下，行业学会引导、医院企业参与的多方合作办学机制。与美国、英国、加拿大、新加坡等国家的知名院校和重庆医科大学、山东医专、天津医专、上海医专、泉州医专、浙江医药高专、遵义医专、黔东南民族职业技术学院、四川中医药高专、广安职业技术学院等医药院校及重庆医药卫生学校、长寿卫生学校等中职学校开展深度校校合作，与武隆等区县人民政府合作探索基层卫生人才订单定向培养新模式，与三峡中心医院等共同探索院校合作人才培养新模式，与云南健之佳健康连锁药店股份有限公司、太极集团、扬子江药业集团、成都康弘药业集团、国药控股重庆有限公司等合作开展校企订单培养，与全国120余家二甲以上医院、大中型企业建立了学生创业就业基地，形成了合作育人、互利互惠、共谋发展的良好格局，毕业生就业率长期保持在99以上。
在半个多世纪的办学历程中，学校始终坚持“立足三峡、辐射两翼、统筹城乡、服务基层”的办学定位，以医学教育和卫生职业教育为主体，先后为三峡库区及周边地区培养了各级各类医药卫生人才10万余名，为三峡库区城乡卫生事业统筹发展和医药产业快速发展提供了强有力的人才和技术支撑。近5年来，荣获省级高等教育教学成果奖一等奖、二等奖、三等奖和省级科技进步奖各1项，建有省级精品课程或精品资源共享课程5门、省级教学团队3个、万州生态涵养发展重点创新团队3个，学生参加国家级、市级职业技能大赛获一、二、三等奖多项。学校先后被国家中医药管理局、重庆市人民政府授予“重庆市文明单位”、“职业教育工作先进集体”、“全国中医药科技工作先进集体”、“招生就业工作先进集体”、“重庆市园林单位”、“重庆市高校学生管理工作先进集体”等称号，是重庆市市级示范性高等职业院校。
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